一二七六年（至元十三年）二月，夏贵以淮西诸郡降元。镇巢军统制洪福，原是夏贵的家僮，因战功任镇巢雄江左军统制。迸戍镇巢军的元军是由阿速人组成，极为残暴。洪福诱使他们入城，备酒设宴款待。元兵酒醉，洪福率领城中居民，将元军全部杀死。夏贵来进行招降，洪福不听。元军攻城报复,城中抗元居民全被屠杀。
一二七七年（至元十四年），元军主力北上与昔里吉作战。三月，宋文天祥复梅州，出江西，进复会昌。四月，张世杰复潮州。江西各地军民群起响应。舒州张德兴杀大湖县丞张德顾，与六安野入原民刘源起兵反元，蕲州傅高也起兵响应，攻据黄州、寿昌，传檄淮东四邵，大江南北诸城邑多乘势杀守将响应。湖北宣慰使郑鼎出兵镇压，义军决堤灌水，元军溃败，郑鼎也舟覆溺死。接着，义军进逼阳罗堡，鄂州大震。七月，元军围剿起义军，寿昌、黄州复陷。九月，司空山寨被攻破，张德兴牺牲。傅高出走江西武宁，在官府的追捕下无处存身，变姓名返乡，被当地官府捕获处死。
在湖南，张世杰派遣祁阳令罗飞围困永州，各地义军闻风响应，常宁的黄必达，新化张虎、周隆，潭州境内的文才喻等，阻山为寨，屠杀长吏。罗飞围困永州达七月。一二七七年十二月，元军攻陷祁阳，罗飞被杀，各地义军也先后被镇压。
浙江处州青田的季文龙、章炎在一二七七年率领淮军余部起义。淮军是张世杰的旧部，临安失陷后，这支队伍有很大部分流散在浙、闽各地。季文龙、章炎起事后，杀赵知府，自署两浙安抚使，环近七县俱起响应。处州总管府达鲁花赤赵责以兵围城。义军突围后又集众二万来攻，列阵于恶溪南岸，双方鏖战，自已至亥。元军万户忽都台合兵来攻，义军失败，季文龙溺死。
福建汀州长汀人黄广德在一二七七年四月称天下都元帅，刻都帅印，自立为天从广德皇帝，设铜将军、铁将军等称号。五月，南剑州沙县谢五十自称挚天将军。黄广德与谢五十军先后被元军镇压。农民军陈大举（陈吊眼）及舍族首领许夫人所率领的诸舍峒民军，与宋张世杰军联合，进攻福州。在福州的原淮军李雄部起而响应，杀死了同知宣抚司事潜说友。由于叛臣王积翁的欺骗和镇压，他们的反抗活动也陷于失败。
南宋灭亡以后，人民的起义斗争，汹涌而起，十分激烈。
杜可用（杜万一）起义一二八○年（至元十七年）四月，江西南康都昌县民杜可用利用白莲会组织起义，有众数万。可用号社圣人，建元“万乘”，自称天王（民间皆事天差变现火轮天王国王皇帝），以谭天麟为副天王，都昌西山寺僧为国师。江西行省参知政事贾居贞与江淮行省参知政事史粥联兵镇压。贾居贞令招讨方文伪装为农商，伏兵仗舟中，驶近农民军居住的茅舍。杜可用失于戒备，和起义军丞相曹某一起被擒牺牲。元朝又一次发布禁令，拘收在民间流传的《五公符》《推背图》《血盆经》等秘密宗教图籍，禁止“一切左道乱正之术”。
林桂芳起义一二八三年（至元二十年）三月，广东新会县林桂芳、赵良铃聚众起义，建罗平国，称“延康”年号，有众万余。同知广东宣慰司事王守信率官军镇压，擒桂芳，又收降林桂芳弟于新会。南海义军三千人被镇压失败，军帅潘舍人被擒。
欧南喜起义一二八三年九月，欧南喜在清远称王，建元称号，设官置署，众号十万，据平康下里东团村等处。增城县蔡大老、钟大老、唐大老等响应。欧将军（欧锺）擒广东道转运盐使合刺普华，切断通往占城的饷道，并遣所部马帅、陆帅和徐相进袭广州，但在元军打击下兵败。欧将军走新会，与黎德会合。时黎德已集船七十艘，众号二十万，别部吴林以船八百艘围冯村。官军大举进剿，黎德、吴林的义军战败。黎德、欧王及其所署都督、丞相、兵马铃辖等二十四人均被元军擒捕处死。
黄华起义一二七八年（至元十五年）张世杰代蒲寿庚，建宁路政和县人黄华集结盐夫，并联络建宁、括苍舍族首领许夫人奉卫王檄起兵，有众四万。张世杰败走后，黄华军降元，屯驻建宁。一二八一年（至元十八年）完者都讨平陈大举，黄华曾担任向导，使元军得以了解山洞之险，迅速致陈大举义军于死地。一二八年（至元二十年），黄华再度举兵抗元，聚众十余万，军士剪发文身，号“头陀军”，用“祥兴”纪年（南宋未帝赵昺的年号）。“福建一道，收附之后，户几百万，黄华一变，十去其四。”（王恽：《秋涧先生大全文集》卷九二）闽中大震。忽必烈急忙抽调在扬州的刘国杰军会合浙西行省的高兴部、参政兀鲁兀伯颜的江淮兵以及福建行省兵，大举进剿。义军攻信州南门，高兴与战于铅山、进陷嘉禾，义军少挫。这时，黄华集众号二十万，分据建宁四区，以示必取。高兴得到建宁受攻危急的消息，即卷甲直趋，会福建之师合击，俘叶都统、梁都统等。黄华败走江山洞，据赤岩山死守。官军猛攻山寨，鏖战半日。起义军终于失败，黄华赴火自焚死。同时起兵的还有青田吴提刑，自署为两浙安抚使。官军讨平之后，在俘获物中有宋前丞相陈宜中的札子和黄华的印榜。
钟明亮（朗）起义一二八九年（至元二十六年）正月，广东循州畲民钟明亮举兵反，拥众十万，进攻赣州，下宁都，据秀岭。时江南义军多达四百余起。元朝政府极为惊慌，忙令签江西行枢密院事也迭迷失率江西行省左丞管如德、福建行省拜降、江推行省忙兀台联兵进讨。五月，钟明亮以众万八千五百人降。闰十月又反，以众万人攻梅州，分遣江罗等八千人攻漳州。韶州、雄州等处的起义军二十余起响应。忽必烈严责也迭迷失、管如德，命与福建、江西二行省合兵镇压。也迭迷失惧怕义军，不敢前往；等义军一走，又诛杀平民冒功。义军利用地形，十分活跃。元廷“虽两省一院并力收捕，地皆溪岭，囊橐其间，出没叵测，东击则西走，西击则东轶。”（《秋涧先生大全文集》卷九二）一二九○年（至元二十七年）二月钟明亮再降，五月又反。广昌的邱元，赣、吉的谢主簿、刘六十，乐安的卢大老，南丰的雷艾江等纷起响应。钟明亮死后，余众继续进行斗争。
杨镇龙起义与钟明亮起义的同时，浙江台州宁海人杨镇龙据玉山县二十五都龙兴山称大兴国皇帝起义，以历某为右丞相，楼蒙才为左丞相，用黄牌书其所居门曰“大兴国”，建年号“安定”。军士在额上刺“大兴国军”四字。一二八九年（至元二十六年）二月一日，杀马祭天，声言受天符举事。义军众号十二万，以七万攻东阳、义乌；余攻嵊县、新昌、天台、永康等处，浙东大震。时诸王瓮吉带谪居婺州，与浙江行省丞相忙兀台调军镇压，败义军新昌，进陷桃源，义军先锋张九被擒。三月，官军逼龙兴山，纵火焚杀，义军溃败。但余部仍坚持斗争，直到一二九○年三月仍在浙东一带活动.
刘六十起义一二九六年（成宗元贞二年）赣州民刘六十聚众万余人起义，建立名号，把斗争的目标指向元朝官府和欺压农民的土豪。元朝派兵去镇压，起义军声势甚盛，元军主将观望退缩，不敢出兵作战。江西行省左丞董士选（董文炳子）去兴国县，处死欺压农民的官吏和激起反抗的豪绅，对起义军分化诱骗。刘六十被擒，起义失败。
元世祖、成宗时期，前仆后继的农民起义，相继遭到镇压而失败，但华夏人民反抗元寇入侵和奴役的斗争并没有终止。各族人民继续在各地以各种形式向元朝统治者展开不屈不挠的战斗。
1284宾州人黄大成率邕州、宾州等地民众起事,梧州等地亦相呼应。湖南宣慰使撒里蛮率兵讨伐。至元二十五年(1288全州义军联合湖南阳峒义军,攻打全州、零陵,杀官吏,夺县库。元廷派副使武清、都指挥杨观等督兵前往镇压,杀义军3000余人,俘100余人
至元二十年(1283年)三月，林桂芳兄弟(南宋琼州知府林获之子)与隐匿在睦洲的赵良(宋室后裔)等抗元起义，在罗旁竖旗，聚众万余。称罗平国，改元延康。兵败，被元军杀害。
至元二十一年(1284年)新会人黎德，反抗元朝称王，设丞相招讨等官，被江西行省知政事也的迷失捕获，招降余党133人，黎德牺牲，黎德弟黎浩及招讨吴兴等被监送京师.
在元代，发生了元灭南宋入浙之战和张三八、陈干的起义，詹老鹞、林雄起义，台州人杨镇龙起义，
在宋末的抗元斗争中,客家人和‘溪峒蛮獠‘是赣闽粤勤王之师的主力。蒙古人得天下后,畲族和客家人同处于最低贱的‘南人‘等级,受尽剥削、压迫和欺凌。现实处境的逼迫,加上爱国思想的激发,使他们的抗元热情最为高涨,在斗争中表现得最为英勇壮烈。畲族、客家两个族群在抗元斗争中同仇敌忾,或同组一军,或声气相通,或犄角相倚,彼此有了更多更深的接触、交流和融合,客家民系就在这个过程中得到空前的发展和壮大。
文天祥、张世杰领导的畲汉人民保宋抗元斗争在宋末的保宋抗元斗争中,文天祥和张世杰分别领导了两支最主要的勤王队伍。
文天祥的活动主要在赣闽粤边山区。史载,‘德佑初,江上报急,诏天下勤王。天祥……使陈继周发郡中豪杰,并结溪峒蛮,使方兴召吉州兵,诸豪杰皆应,有众万人。‘‘郡中豪杰‘是指文天祥家乡吉州的地方豪强,‘溪峒蛮‘是尚未汉化的少数族类。响应文天祥勤王号召的‘溪峒蛮‘也以江西南部为多,但邻近州郡的豪强和‘溪峒蛮‘响应勤王号召的也不少,如祥兴二年(1279)‘龙泉县张三八合众二万‘,‘衢州贼陈千二聚二万人,遂昌叶丙六亦聚三千人助之,翌年‘沙县盗起‘,这里所谓‘贼‘、‘盗‘都是元朝统治者对于抗元民众武装的诬称。同在祥兴二年,邵武、建昌、吉抚等岩洞山寨的‘溪峒蛮‘也起兵抗元,其领袖自称大老,引至元廷发大军征讨1；同年十一月,闽北和浙南括苍的盐夫联络畲民起义抗元,元廷也被迫‘诏调兵讨之‘。由此可见,文天祥最初组织到的万人抗元武装,是闽浙赣地方武装和‘溪峒蛮‘相结合的畲汉联军。
文天祥的抗元军事行动主要集中在赣闽粤交界区域展开。宋恭帝降元之后,益王立于福州,文天祥被任命为右丞相,旋以同都督身份出江西,收兵入汀州。其部将分兵攻取宁都、于都,然后会兵于汀州。景炎二年(1278)正月,元兵攻入汀州,天祥退军漳州；四月,入梅州,五月,出江西,入会昌。六月,入兴国县。七月,遣主力攻赣城,分兵攻取吉州各县,抚州、分宁、武宁、建昌等地的豪杰,都派人来表示接受文天祥的指挥,只有赣州久攻不下。后来元朝派大将李恒增援赣州,文天祥兵败,收残兵奔循州,驻南岭。翌年周旋于粤东地区,十一月,进屯潮阳县,在前往惠州海丰途中被元军张宏范部俘虏于五坡岭。上述这些地区,正是后来的客家大本营范围。
客家人是文天祥抗元军的主力,表现出极为可贵的爱国献身精神。清人徐旭曾据所见资料做了这样的概括:‘元兵大举南下,宋帝辗转播迁,南来岭表,不但故家世胄,即百姓亦多举族相随,有由浙而闽,沿海至粤者,有由汀赣逾岭至粤者,沿途据险,与元兵战,或徒手与元兵搏,全家复灭,全族复灭者,殆如恒河沙数。‘这里所说随宋帝南迁的百姓固非全部是客家人,但以客家人为多。有些本非客家的人士随帝迁至粤东而又幸存下来者,日后也演变为客家人。原居粤东客家人对于抗元大业的支持尤其不遗余力,所以,文天祥抗元之师‘势至梅州而大振,男执干戈,女贯甲裳,举旗起义,倾邑勤王‘。其中梅州‘松口卓姓有800人勤王,兵败后只存卓满一人。‘
张世杰统帅的是淮军,主要活动在江浙闽粤沿海一带,特别是益王被立为帝之后,张世杰一直是为益王保驾的主力部队,从定海到温州、福州,再到泉州、漳州、潮州,还曾进攻过雷州,最后在崖山与元军作殊死战。陆秀夫、帝丙曰及杨太后投海而死后,张世杰葬之海滨,自己亦自溺死。
张世杰的抗元活动,得到畲族人民的有力配合,特别是他在漳、泉一带作战时,陈吊眼、许夫人所部畲军在张世杰的统一领导下直接参加了攻城之战。史载,‘张世杰围泉州,将淮军及陈吊眼、许夫人诸洞畲军,兵威稍振。‘另外,在崖山之战的危急时刻,管领海舟的陈植‘见事危,断维出港,自以六舟泊梅岭,募士卒,驰檄诸蛮,图立宋后。‘所谓‘诸蛮‘,仍是以畲族为主。于此可见客家和畲族人民在这场惨烈斗争中的中坚作用。客家人和畲族人民在共同抗元的斗争中经受了一次密切合作、并肩作战的洗礼,他们相互间的融合掀开了一页新篇章。
宋亡之后,畲汉人民的抗元斗争还坚持了很长时间。元军征服广东的进程遇到很大的障碍,畲汉人民的抗元斗争如火如荼,坚持了很长的时间。除了陈吊眼本人及余部在潮汕地区的反抗行动外,粤东各地各种不同形式的‘乱事‘此起彼伏,顽强地向蒙古统治者挑战。
董贤举被称为‘广东贼‘,具体籍贯不明,他与同伙七人‘皆称大老,聚众反,剽掠古、赣、瑞、抚、龙兴、南安、韶、雄、汀诸郡‘称‘大老‘是畲族首领的习惯,吉、赣、瑞、抚、龙兴、南安、韶、雄、汀诸郡是当时畲族的重要分布地,可知董贤举等7人应属畲族,或是畲化了的汉人,他们领导的这伙‘广东贼‘是一支畲族抗元武装。他们的活动初见于记载在至元二十五年(1288)四月,记载说朝廷‘连岁击之不能平‘,那么他们的造反行动最起码应在此二三年前。
对于董贤举等七大老聚众反元,元朝地方和中央的统治者都很震动。元朝在江西的军事长官月的迷失感受的压力最大,他自觉兵力不足,上奏朝廷说:‘广东穷边险远,江西、福建诸寇出没之窟,乞于江南诸省分军一万益臣。‘乃至董贤举之众势不可挡,月的迷失又请益兵,江西行省行政长官忽都铁木儿‘亦以地广兵寡为言‘,朝廷因而‘诏江淮省万户一军诣江西,俟贼平还翼‘。同年七月戊戌,月的迷失又进而要求:‘近以盗起广东,分江西、江淮、福建三省兵万人令臣将之讨贼。臣愿万人内得蒙古军三百,并臣所籍降户万人,置万户府,以撤木合儿为达鲁花赤,佩虎符。‘‘诏许之‘。
朝廷选派得力干将,调遣江西、江淮、福建三省大军,还出动了最精锐骁勇的蒙古军,并专门为此设立万户府,用以对付董贤举之反,恰好说明这次造反行动规模之大,战斗力之强,群众基础之深厚。但一波未平,一波又起,循州钟明亮又揭起反元大旗,‘杀掠州县,千里丘墟,亮命如德统四省兵讨之‘。
崖山战后，元军灭了南宋皇朝，占据了中国。为巩固其统治，实行高压政策和大屠杀，出现“十年兵火万人悉愁，千百中无一二留”的悲惨景况。特别是元朝统治者对南宋宗室遗裔、遗臣，大肆搜捕，不遗余力。在崖山战后第六年（即1285年），元世祖忽必烈还下诏“追捕帝*（上下构结：曰丙）及陈宜中”。相传，逃往安南的宋室遗裔遗臣，被元兵捉回400多人，屠杀殆尽。其结果，激起宋室遗民的民族义愤。在广东、在新会，不断发生抗元复宋的起义斗争。
海门潮至起波涛，犹似当年拥万艘“。抗元复宋之兵，风起云涌，经久不息。早在崖门战败后，宋军义师继续抗元的，就有新会邓荣，继续与元兵作战，被掳不屈牺牲。还有何时，仍率民兵与元兵苦战，直至兵穷力竭，最后和妻候氏投水殉节。此外，居于黄梁都的宋宗室赵若榉，曾召募潮居里居民数百勤王卫宋。
这一年，有香山马南宝联络新会起义军黎德、梁起梓的兵马，率兵前往越南运粮，迎接南宋留在越南的散兵。不幸失败，马南宝被捉，不屈而死。
抗元复宋的起义，此起被伏，延绵不断.元朝统治者对起义军的镇压，更激起各地人民的反抗，义师风起云涌、此伏彼起，为维护华夏民族大义的斗争逐步在扩展,直至元庭殖民政权的覆灭.